La maestría propone formar investigadores con calidad humana y académica, dotados de una visión interdisciplinaria y comprometidos con el servicio y búsqueda de resolución de problemas emergentes y prioritarios a nivel local, nacional e internacional, que impulsen el avance de las ingenierías y las ciencias través de la investigación y el desarrollo tecnológico. El programa tiene como meta incrementar los conocimientos y habilidades de quienes se han formado en los cameos de la ingeniería, ciencias naturales como lo pueden ser en las siguientes ingenierías: Industrial, en Sistemas Computacionales, Bioquímica, Electromecánica, Gestión Empresarial, Civil, Ambiental, Tecnologías de la Información y Comunicación y Petrolera, por mencionar algunas. Estos conocimientos y habilidades les permitirán realizar tareas de investigación y desarrollo tecnológico en temas prioritarios que impulsen el desarrollo del país con una visión ética, sustentable y tecnológicamente viable. El programa de la Maestría en Ciencias de la Ingeniería busca vínculos con la industria y el sector servicio de las MPyMes. aprovechando los esquemas de apoyo y financiamiento accesibles a través distintas dependencias y secretarías de estado en la búsqueda de estímulos para la investigación e innovación científica, promoviendo el vínculo con el sector empresarial.

a LGAC Optimización de Procesos para la Sustentabilidad Ambiental, tiene por objetivo formar investigadores con habilidades para diseñar, mejorar y gestionar los procesos productivos y administrativos, para elevar la calidad y la productividad de los sistemas de bienes y servicios de manera innovadora a través de técnicas, herramientas y metodologías avanzadas de la ingeniería y tecnología industrial, para contribuir a la mejora continua del entorno productivo y al desarrollo sustentable de la sociedad. Las temáticas más sobresalientes relacionadas a esta LGAC, son:
1. Procesos Ambientales.
2. Procesos agroindustriales.
3. Procesos bioquímicos.

La LGAC Sistemas Inteligentes y Optimización Industrial, tiene como objetivo explorar las nuevas tendencias tecnológicas y generar conocimiento para apoyar a empresas y sociedad en la toma de decisiones. Teniendo como base la inteligencia artificial, el reconocimiento de patrones y las tecnologías emergentes de la información aplicadas a los sistemas existentes en diferentes campos de estudios. Las principales soluciones que atiende esta LGAC son:
1. Aplicaciones de la Inteligencia Artificial.
2. Ciencia de Datos.
3. Automatización y control.

La LGAC Innovación, Desarrollo y Sustentabilidad en Economías Emergentes, tiene como objetivo formar capital intelectual calificado con un enfoque holístico de la realidad local con visión global, desde el análisis del comportamiento financiero y aprovechamiento sustentable de los recursos naturales de la región. A través de la aplicación de técnicas de la ingeniería se proponen alternativas de solución innovadoras a los problemas que limitan el desarrollo regional. Las temáticas más sobresalientes de esta LGAC son:
1. Aprovechamiento de los recursos naturales.
2. Comportamiento financiero.